Друскининкай назван в честь соли, одного из самых ценных и незаменимых товаров древности. Уже в XVII веке местное население узнало о целебных свойствах местной соленой воды.
Официальной датой основания курорта Друскининкай считается 20 июня 1794 года, когда великий князь литовский и король польский Станислав Август Понятовский своим указом присвоил этой местности статус лечебного места. Минеральная вода была протестирована, а ее лечебные свойства научно подтверждены. Перед Друскининкой открылись новые перспективы.
В 1837 году проект строительства курорта был одобрен российским императором Николаем I. На реализацию проекта была выделена ссуда в размере 25 000 серебряных рублей. Болота были осушены и заменены аллеями с белым песком. Построены первые оздоровительные центры. Построены теннисные корты и дорожки для боулинга. Летом открывается театр. Открылся один из первых в Литве фотосалонов…
В конце XIX — начале XX века Друскининкай был модным местом летнего отдыха. По популярности в Российской империи Друскининкай уступал только курортам Крыма и Кавказа. Лето в Друскининкае проводили высокопоставленные лица и артисты Петербурга, Варшавы, Гродно и Вильнюса.
В межвоенный период в Друскининкае начали пропагандировать принципы здорового образа жизни. В парке талантливой целительницы Евгении Левитки для лечения использовались естественные природные факторы: солнечный свет, температура воздуха, сила воды.
E. После Второй мировой войны дело Е. Левитки продолжил пионер литовского спорта Каролис Динейка, который возродил парк ко второй жизни: он развил и дополнил парк новыми оздоровительными методиками, создал павильон для каскадов и аэроионотерапии, пешеходную и велосипедную дорожку «Саулес».
Когда Друскининкай стал курортом союзного значения, санатории начали работать круглый год. Было построено много крупных железобетонных сооружений: санатории «Эгле», «Летувос», «Вильняус», «Нямунас» и другие, физиотерапевтический курорт (ныне Аквапарк).
В начале 1990-х годов, после прекращения туристических потоков из бывшего СССР, Друскининкай пережил кризис. В 2000 году муниципалитет Друскининкая начал возрождать курорт, поощряя и инициируя создание центров притяжения туристов и предоставляя стимулы для развития бизнеса. В 2003 году после реконструкции открылся курорт Друскининкай, а журнал Newsweek включил Друскининкай в десятку лучших бальнеологических курортов Европы.
За последнее десятилетие была обновлена инфраструктура города, приватизированы и реконструированы отели и санатории. В 2006 году был открыт Аквапарк, в 2011-м — крытый зимний развлекательный комплекс Snow Arena, в том же году был построен новый мост через Нямунас. В 2012 году после реконструкции открылись Старый курортный парк и Музыкальный фонтан. В 2015 году экологичная канатная дорога соединила обе стороны Нямунаса. В период с 2000 по 2015 год только в реконструкцию общественных объектов было вложено более 300 миллионов евро из городского бюджета и различных фондов. По сравнению с 2000 годом (39 000 человек) количество туристических прибытий увеличилось в 8,5 раз (340 000 человек в 2018 году).